PH стула обычно нейтральный или слабощелочный (6,8-7,5). Более кислый стул, физиологический только у новорожденных, может указывать на кишечные инфекции (кишечная палочка, ротавирус) или расстройства пищеварения, такие как непереносимость лактозы или жира (стеаторея из-за недостаточности поджелудочной железы или стаза желчных путей).
Уровень pH стула зависит от пищевых привычек пациента; например, диета, чрезмерно богатая мясом и молочными продуктами, делает стул более щелочным. Гнилостная кишечная бактериальная флора фактически разрушает аминокислоты, которые не всасываются, образуя токсичные амины с неприятным запахом; следовательно, pH фекалий имеет тенденцию повышаться в результате увеличения производства аммиака. Поэтому не случайно, что слишком щелочной pH в фекалиях, сопровождающийся снижением содержания короткоцепочечных жирных кислот (см. Бутират), был связан с повышенным риском колоректального рака.
Если pH фекалий имеет тенденцию к увеличению при наличии гнилостного дисбактериоза, он имеет тенденцию снижаться при наличии ферментативного дисбактериоза, причины которого следует искать в чрезмерном приеме углеводов или их плохой абсорбции ( глютеновая болезнь). Даже при «обильном потреблении липидов, при вегетарианской диете и при длительном голодании pH стула становится кислым».
Во избежание искажения результатов теста стул не должен быть загрязнен мочой и должен быть быстро охлажден, чтобы аммиак в моче и гнилостные бактерии не сделали щелочной pH кала.